BIOPROCESSING
„BIO-FELDOLGOZÁS”
Ipari biotechnológia kulcslépései
3. Downstream
processing: a kívánt termék tisztítása, kiszerelése
Nyersanyag
Nyersanyag előkészítés
Fermentáció, biotranszformáció
Termék termék
kinyerés, kiszerelés
1. Upstream processing: a nyersanyag előkészítése a fermentációra, vagy
transzformációra
2. Fermentáció,transzformá- ció: bioreaktorokban
sejtszaporítás,
antibiotikum, fehérje, stb.
előállítás
1. Upstream
- bioreaktorok - tápanyagok - sterilizálás - oxigénellátás
- aerob/anaerob fermentálás
2. Downstream
- sejt izolálás - feltárás
- extrakció
- fehérje tisztítás - kiszerelés
- melléktermékek, hulladék kezelés
Fermentáció
• A gyógyszer-, élelmiszer-, és vegyiparban használt (bio-) termékek előállításában a mikrobiális fermentációknak nagy jelentőségük van
• Fermentáció hatékonysága sajnos gyakran elmarad a teoretikus maximumtól
• Mikroba fiziológia
• Rekombináns sejtekkel történő fermentációk
• Mikrobiális konverziók – fermentáció
• Enzimatikus folyamatokon alapuló konverzió – biokonverzió
• Fermentor– reaktor, melyet mikrobiális konverziókra haszn.
Fermentációs eljárások típusai
Nyílt és zárt rendszerek
• Szakaszos fermentáció (Batch)
– a reaktánsokat (tápanyagok, sejtinokulum, gázok – folyamatos
levegőztetés) együtt visszük a rdsz-be a fermentáció megkezdése előtt – alapvetően zárt rdsz
– térfogat állandó
– Egyszerű eljárás, de termékgátlás ill. szubsztrát gátlás lehetséges
• Rátáplálásos szakaszos fermentáció (Fed-batch)
– a tápanyagokat folyamatosan adagoljuk (szubsztrát gátlás elkerülése) – a térfogat nő, mert nincs elvezetés
• Folytonos fermentáció (continuous)
– nyitott rdsz
– amennyi tápanyagot bejuttatunk, annyi térfogatnyit el is veszünk – paraméterek állandóak
• Félfolytonos fermentáció (semicontinuous)
– szakaszos fermentációk sorozata, melyben a fermentlé kb 10%-át a
bioreaktorok
• Központi szerep, a bioreakciók helyszíne
• Fontos a sejt kinetika, anyagtranszfer, folyadék keveredés a bioreaktor tervezéshez
• Bioreaktor – hardware és software szabályozás, a mikroorg.
számára fontos környezeti faktorok szinten tarthatók
– Kultúra paraméterei: hőmérséklet, keverési sebesség, nyomás, gázáram, pH, pO2, esetleg pCO2, hígulás mértéke
– Nagy felbontású (elsősorban laboratóriumi, az optimalizáláshoz)
bioreaktorokba lehet on-line optikai denzitás mérés, szubsztrát konc.
meghat.
Bioreaktor konfigurációk
A bioreaktor (fermentor) egy edény, melyben a biológiai reakciókat
kivitelezzük:
• mikroorganizmus szaporítása, enzim- vagy immobilizált sejtes reakciók, szövettenyészetek
• méret: 0,5-2 000 000 l
• üveg-rozsdamentes acél, esetleg műanyag
• Alapvető paraméterek nyomon- követhetők
• Mintavételezési lehetőség
• Kevertetés -nyíróerők
Bioreaktor konfigurációk
1. Görgetett edény
• Ált. műanyagból
• Horizontális kialakítású, lassú keveréssel
• Megfelelő levegőztetés, anyageloszlás érhető el
• A sejtek a henger belső felszínéhez tapadva
szaporodnak, nem lepi el folyamatosan a
tápoldat
• A töltet a henger térf.
max 30%-a lehet
• Olcsó, de a kontroll, és monitor nem hatékony
Bioreaktor edény
Szabályozó egység
Görgető rendszer
2. Kevertetett tank bioreaktorok
• Leggyakrabban használt típus
• Mechanikus keverő rdsz-rel ellátott
• Rozsdamentes acél (kisebb térf-nál lehet üveg)
• Magasság:átmérő arány (1:1, 3:1)
• Keverés keverőlapátokkal, azok kialakítása a nyíróerők szempont- jából fontos
• Levegőztetés megoldása
• Sejtek denzitása ált. 106-107 sejt/ml, de ez javítható akár több
nagyságrenddel is
• Mérete akármeddig nem növelhető a keverés, oxigénellátás, hőmérséklet tartás miatt
Bioreaktor konfigurációk
Kevert tankreaktor (angol: stirred tank
bioreactor ‘STB’)
3. Air-lift bioreaktorok
• Egyszerű, olcsó
• A reaktor belsejében egy központi cső, un. emelő (riser), és egy külső
hengeres gyűrű un.
levezetőcső (downcomer)
• Fertőzés veszély is csökken
• Sejtek denzitása ált. 106 sejt/ml
Bioreaktor konfigurációk
távozógáz
Belső cső elem a gáz áramlás biztosítására
Gáz buborék
Gáz elosztó áramlásmérő
Gáz beinjektálása
4. Fluid-ágyas bioreaktor
• Hordozó, sejtaggretátok, kisebb térfogat (max 100 L)
• nagy sejtmennyiséggel – szuszpendált és kitapadó sejtek is
• Transzport folyamatok - nem elég hatékony
• Fejlesztés kollagén mikrohordozóval jó eredmények
• Reciklizáló cső
• Sejtek denzitása ált. 108 sejt/ml
Bioreaktor konfigurációk
5. Üreges szálas-bioreaktorok
• Egyszerű, de max néhány liter
• Kapilláris szálak egy henger
testben, mindkét végén tapadnak
• A sejtek a kapillárisok közötti térben szaporodnak (szövetszerű)
• Főleg humán sejtkultúrák számára
• Sejtek denzitása 108 sejt/ml
• Termék visz. tisztán nyerhető
Bioreaktor konfigurációk
7. Fix ágyas bioreaktorok
• A sejtek hordozóhoz (pl. aktív szén) kötötten, vagy polimerbe csomagoltan
• Fluid ágyassal szemben előny a stabilitás
• Hátránya, hogy a transzport folyamatok mértéke kisebb, grádiens alakulhat ki a bioreaktorban
(nem lesz homogén a rdsz)
• Sejtek denzitása ált. 106-107 sejt/ml
• Termék kinyerése nehézkesebb 1. Kerámia ágyas bioreaktorok
• Kerámia hordozó, újrahasználható, költséghatékony
• Jó minőség, hőmérséklet tolerancia
• Széles körű felhasználás
• Inhomogenitás lehet a reaktorban
• Sejtek denzitása ált. 107-108 sejt/ml
Bioreaktor konfigurációk
keverés
• Mechanikus propellerek segítségével
• Levegő áramoltatás segítségével
bioreaktor
termék
hőcserélő
keverés
• Feladata a megfelelő anyagtranszport fenntartása, azaz a beáramló levegő, a tápoldatban oldott (vagy nem oldott) tápanyagok, és a keletkező termékek egyenletes
eloszlatása
• Az egyes oldatok viszkozitása szintén befolyásolja a
keverés módját, mértékét. Ez az időben változhat, egyrészt a szaporodó mikróbák, valamint a keletkező termék miatt.
• A kevertetés mértéke akármeddig nem növelhető a nyíróerők miatt
• A keverés sebességét és a levegőztetés sebességét
egymást figyelembe véve kell optimalizálni (ne alakuljanak ki légüregek)
Propeller fajták
levegőztetés
Eltérő oxigénigény
• aerob/anaerob szaporítás
• baktériumok/gombák
• enzimes/sejtes folyamatok Oldott oxigén szint
• oldhatóság mértéke hőmérséklet függő
Buborék méret
• túl nagy buborék – hiába
juttatunk sok levegőt be, nem hasznosul
• intenzív keveréssel lehet apró buborékokat nyerni
• eleve apró buborékképzés - pezsegtetés
belső külső
oxigénellátás
tápközeg
Szilárd v. folyékony
Természetes, félszintetikus, szintetikus Tápanyagok:
• Szén-, energiaforrás
• Nitrogénforrás, egyéb ásványi anyagok
• Mikroelemek
• Vitaminok
• Növekedési faktorok
Szén-, és energiaforrások
Természetes:
– melasz: a cukorgyártás mellékterméke. ~ 50%
cukortartalom, de emellett jelentős nitrogénforrás is – sajt/tej permeátum: 6-7% szárazanyagtartalom, főleg
laktóz, kevés zsír, fehérje, ásványianyagok
– Magáztató folyadék (corn steep liquor-CSL): a magok
nedves őrlése során keletkezik, cukrok és kismolekulasúlyú N tartalmú vegyületek
– Manióka v. cassava: 20-40% keményítő, kevés fehérje, zsír – Bagasse: cukornádból a cukor kinyerése után visszamaradó
rostos anyag
Drágább, de természetes alapú alapanyagok:
– húskivonat: fehérjéket, aminosavakat tartalmaz. Húsleves bepárlásával állítják elő. Lekvárszerű illetve por alakú
– pepton: fehérjék savas vagy enzimatikus hidrolízisével állítják elő. Vízben könnyen oldódik. A fehérjék tripszines lebontásával (mely egészen az aminosavakig megy)
keletkező magas triptofán tartalmú pepton a Trypton – Élesztőkivonat
Pontos összetételük nem mindig ismert, változhat, ezért pl.
laborban a kísérletek kivitelezése során inkább jól definiált alapanyagokat használunk
Szén-, és energiaforrások
Nitrogén források
• Szervetlen:
– nitrát sók, ammónium sók
• Szerves
– Kukoricalekvár: a kukoricaszem áztatása során keletkező áztatólé 50%-ra töményítve
– Húskivonat – Pepton, tripton
egyebek
• Szervetlen ionok:
– Foszfor, kén, vas, nyomelemek
• Növekedési faktorok:
– melyekre a mikróbáknak szükségük van szaporodásukhoz, de szintetizálni nem tudják
• Szelektív ágensek:
– Specifikusak az adott mikrobára, másokra gátló hatásúak
• Habzás gátlók
– csökkentik a felületi feszültséget (a folyadék-gáz határfelületen), ennek következtében a légbuborékok átmérője kisebb lesz
• Szelektív körülmények
– Pl. szén-, nitrogén forrás limitáció- elősegítheti bizonyos anyagok intenzívebb termelődését, extracelluláris termékek képzése
– Van elég szénforrás, de kevés a nitrogén forrás poliszaharid, PHA felhalmozás (akkumuláció) lehet
• Szennyező mikroorganizmusok elpusztítása a fermentáció előtt
– Hőkezelés, sugárzás (UV, gamma), kémiai ágensek, ultrahang, szűrés
– Hőkezelés gőzzel, ha nyomást is tudunk alkalmazni, jobb a hatékonyság, rövidebb idő elég (teszt organizmus
Bacillus stearothermophilus)
– Spórák elpusztítása érdekében néha többszörös sterilezés szükséges, ez azonban károsíthatja a tápanyagokat (pl.
cukrok karamellizálódnak)
sterilezés (csíramentesítés)
sterilezés (csíramentesítés)
Tápoldat + gáz sterilezés Folyadék
- szűrés/ülepítés
- kémiai-, hő- inaktiválás 1. Szűréssel:
- cellulóz alapú filterek, pórus átmérő igény szerint változó 0,2 - 0,45 mm
2. Inaktiválással:
- hőkezelés: teszt mikróba: Bacillus stearothermophilus hőérzékeny tápkomponensek
3. Kémiai:
hypo, formaldehid
oxidálószerek (pl. H2O2, peroxiecetsav)
Gáz
- szűrés
- UV, röntgen - kémiai
Mi szennyez?:
– penészgombák >> egyebek
– fágok kiszűrése még ma sem megoldott Szűrés
– filterek –hidrofób jelleg
– formaldehiddel átitatott üveggyapot
– kritikus sebesség/perc hatásfok igény: 0,5 - 1,5 térf.
sterilezés (csíramentesítés)
Fermentációs termékek
• Sejt pl. élesztő, SCP
• Elsődleges metabolitok pl. citromsav, etanol, glutaminsav (ált. 200 000 L kevertetett tank fermentorokban)
• Másodlagos metabolitok pl. antibiotikumok (ált. 50 000 – 200 000 L térfogatban)
• Enzimek (főleg extracelluláris, pl. amilázok, proteázok, lipázok. 30-220 m
3térf)
• Terápiás fehérjék pl. interferon, növekedési hormon, inzulin…
• Vakcinák pl. hepatitis-, szamárköhögés ellen
termékkinyerés
Centrifugálás, ülepítés, szűrés - sejtek összegyűjtése
• Ha sejtalkotót, vagy intracelluláris terméket áll. elő szükséges a sejtek feltárása:
– mechanikai: örlő malom, ultrahang, nyomás – kémiai: szerves oldószerek, detergensek
– enzimatikus: lizozim (G+ baktériumokra, G- esetén SDS-sel együtt)
• Extrakció, filtráció, adszorbció, kicsapás
– Kis molekulák kinyerése pl. folyadék-folyadék extrakció
• Oldószeres –hidrofób termék esetén
• Detergens segítségével
– Filtráció – szűrőn áteresztjük, dializis
– Adszorbció - hordozóhoz kötjük a kinyerni kívánt anyagot
– Kicsapás – csapadékot képzünk pl. magas sókonc-val (pl. ammónium-szulfátos)
• Tisztítás
– Kromatográfia (álló- és mozgó fázis)
Sejtek összegyűjtése, koncentrálása
centrifugálással
Sejtek feltárása ultrahang (1), detergens (2),
nyomás (3), örlő malom (4) segítségével
Kromatográfiás folyamatok
• Kromatográfia elválasztási módszer.
• Kromatográfiában az állófázis (mely ált. porózus, nagy felülettel rendelk. anyag) és a mozgófázis (ált. folyadék vagy gáz) között megoszlanak az anyagok egyensúlyi állandójuk szerint.
• A mozgófázis magával ragadja a vizsgálandó anyagot, amely így a befecskendezési ponttól a detektorig (érzékelő berendezés) jut.
• Az állófázissal erősebb kölcsönhatással
rendelkező anyagok később távoznak, mint a gyengébb kölcsönhatással rendelkezők.
• Az anyagok vándorlásuk során egyre szélesebb
tartományt foglalnak el.
Kromatográfia - gélfiltráció
• Molekula méret szerinti elválasztás
• Töltet: porózus szemcsék
– Természetes polimerek (pl. dextrán, agaróz) – Szintetikus polimerek (pl. poliakrilamid)
• Magas sókoncentráció mellett fehérjék képesek/hajlamosak poláros felszínhez kötődni
• A sókonc. csökkentésével a fehérjék leválnak a hordozóról, eltérő sókonc-nál hidrofób tulajdonságuknak megfelelően
Kromatográfia - Hidrofób kromatográfia
Kromatográfia - Affinitás kromatográfia
• Gélágy ligandja specifikus affinitással bír az
elválasztandó anyaghoz
• Az adszorbeált termék leválasztása pl.
sókoncentráció, pH
változtatás, vagy akár a ligandot az eluáló szerhez adjuk
• Erős kationcserélő oszlop:
a negatív töltésű
állófázison pozitív ionokat választunk el.
• Erős anioncserélő oszlop:
pozitív töltésű állófázison negatív ionokat
választunk el.
• Ioncserélő kapacitás függ az állófázison kötött
töltések számától.
• A termék leválasztására ellenionokat tart-ó eluenst haszn.
Kromatográfia - Ioncserés kromatográfia
kiszerelés
• Kristályosítás
– A kristály - csak egyféle anyag alkothatja a kristályrácsot
• Szárítás
– ált. nagy felületen forró levegővel
• Liofilizálás
– hőérzékeny termékekre: vitaminok, enzimek, vakcinák, mikróbák,
gyógyhatású fehérjék
• Csomagolás
• Hulladékkezelés