DNS amplifikáció
(
egy DNS szakasz sokszorosítása - amplification)
pl . DNS szekvenálásnál nagy jelentősége van
- sejten belül (in vivo) pl. E. coliban
Sejten kívüli DNS sokszorosítás
• használták az E.coli DNS polimerázát is
• az áttörést azonban a hőstabil DNS polimeráz (Taq)
hozta, ami a Thermus aquaticus -ból származik
PCR (polimeráz láncreakció)
• A PCR egy automatizált DNS sokszorosító, amit az amerikai kutató Kary Mullis fejlesztett
ki a 80-as években
• Ennek kifejlesztését a Taq polimeráz tette
lehetővé, mivel megnövelte a PCR
A PCR-hez szükségesek
• hőstabil DNS polimeráz (Taq)
• templát DNS a cél szekvenciával
• dATP, dCTP, dGTP,dTTP
• reverse és forward oligonukleotid primerek
• Mg
2+ion a polimeráz enzim aktivitásához
• pH stabilizáló puffer (Tris-Cl) és KCl
A PCR ciklikusan működik
Elődenaturáció 2 perc 95 °C
• A denaturáció során a dupla DNS szál ketté válik ez 95°C-on 30-60 s-ig tart
2. A primerek kötődnek a DNS szálakhoz 3’ irányba, ez kb. 55- 60°C-on 30-60 s-ig tart
3. A szintézis során a polimeráz enzim 3’-5’ irányba kb. 2000 nukleotid/perc sebességgel dolgozik, 60-120 s 72-78°C-on
Ezt a ciklust pl. 30-szor megismétli az automatizált termosztát és