Biokémia
Wunderlich Lívius PhD.
BME
livius@mail.bme.hu
2020
Alapkövetelmények
- Középiskolai kémia:
Általános és szerves kémia fontos Szervetlen kémia kevésbé fontos
(csak a biológiailag releváns elemek, vegyületek) Kémiai technológia nem kell
- Középiskolai biológia:
Sejttan, szervtan, élettan, biokémia fontos Rendszertan, genetika kevésbé fontos
Szupra-individuális szintek, etológia nem kell
Tematika
-Gyorstalpaló kémia
-Gyorstalpaló sejtbiológia -Leíró biokémia
-Enzimológia -Bioenergetika
-Szénhidrát anyagcsere -Lipid anyagcsere
-Fehérje anyagcsere
-Nukleinsav anyagcsere
-Replikáció, transzkripció, transzláció -Táplálkozás, biotranszformáció
és ami még belefér…
Vizsgakövetelmény:
Az előadáson elhangzott tananyag
Aláírás követelmény:
2016.10.06.
2016.10.27.
2016.11.17.
3 db rövid írásbeli ZH A két legjobb számít
Összesített átlag legyen legalább 50%
Nincs javítási lehetőség!!!
Ajánlott olvasmányok:
Ádám et al.: Orvosi biokémia
Csermely et al.: Bioorganikus kémia Mandl József: Biokémia
Gergely et al.: Általános és bioszervetlen kémia
…vagy bármely biokémia könyv viszonylag új verziója Wunderlich, Szarka: A biokémia alapjai
www.interkonyv.hu oktatas.ch.bme.hu oktatas
konyvek biokemia
Egeszsegugyi mernok biokemia
???
Kémia gyorstalpaló
Az atom szerkezete
Avogadro-szám: 6,022x1023 = 1 mol anyag
Töltés, tömeg
Az atomok szerkezete
2 e
- atompályánkéntElemek: Azonos protonszámú atomok anyaghalmaza Vegyületek: Különböző protonszámú atomok
anyaghalmaza
Izotópok: Azonos protonszámú, de különböző neutronszámú atomok
Biogén elemek elktronhéjai
Az urán elektronhéjai
Atompályák
Különböző atompályák alakjai
Alhéjak: milyen alakú atompályák vannak benne
Az alhéjak energiája
Elektronhéjak
Elemek tulajdonságai:
Milyen a legkülső elektronhéj/alhéj elektronszerkezete
Elektron-vonzó képesség
Az elemek előfordulási valószínűsége
Atomos állapotban: Csak a nemesgázok
Elemi állapotban is csak kevés elem, többi vegyületben
A biológiailag fontos elemek
???
1. Ionos kötés: ΔEN > 2
Elsőrendű kötések
Elsőrendű kötések
2. Fémes kötés
3. Kovalens kötés
Elsőrendű kötések
Elsőrendű kötések 3. Kovalens kötés
Kötő és lazító molekulapályák
Elsőrendű kötések
3. Kovalens kötés
σ és π kötések
Datív (koordinatív) kötés
Hidrogén-híd kötés
HF
H
2O
NH
3Dipólus kölcsönhatás
Van der Waals / London féle erők
???
Szerves vegyületek
Szénvázas vegyületek, többnyire H-t is tartalmaznak Elmosódó határvonal:
Rendűség: Hány kötéssel kapcsolódik más atomhoz, mint a hidrogén
Hidrofil illetve hidrofób molekulák/csoportok:
Mennyire képesek a vízzel dipólus kölcsönhatásba lépni
Alkánok
Szénlánc eredetű csoportok
Cikloalkánok
Aromás vegyületek
Benzol
Heterociklusos aromás vegyületek
Piridin
Imidazol
Pirimidin Purin
Szerves molekulák legfontosabb funkciós csoportjai:
Acil
Észter Acetál
Éter
???
CH3 CH2 OH CH3 O CH3 CH3 C O
CH3 CH3
CH O
CH2
Izoméria 1. Kapcsolódási izoméria
C2H6O C3H6O
1,2-pentadién 1,3-pentadién 1,4-pentadién
kumulált konjugált izolált
Izoméria
2. Helyzeti izoméria
2. Helyzeti izoméria
Izoméria
Izoméria
3. Tautoméria
Geometriai izoméria
Geometriai izoméria
Sztereoizoméria
Kiralitási centrum: 4 ligand
C (N, P, S)
Sztereoizoméria
Több kiralitási centrum esetén:
Epimerek
Sztereoizoméria
Konformáció
Konformáció
???
Kémiai reakciók
- Az atomok/ionok/molekulák reagálni képesek egymással.
- A funkciós csoportok jelenléte nagymértékben befolyásolja az adott molekula hajlandóságát egy adott típusú kémiai reakcióra.
x·A + y·B n·C + m·D [C]
n·[D]
m[A]
x·[B]
yK =
szubsztitúció
addíció (elimináció)
izomerizáció
A reakciók típusai
Mechanizmusok: - Elektrofil - Nukleofil - Gyökös
Sav-bázis reakciók: protonátmenet Redox reakciók: elektronátmenet
Exergonikus reakciók: Maguktól végbemennek (ΔG: -) Endergonkus reakciók: Maguktól nem mennek
végbe (ΔG: +)
Sav-bázis elméletek
Savak reakciója vízzel
Bázisok reakciója vízzel
Konjugált sav-bázis párok relatív erőssége
A víz autoprotolízise
Protonkoncentráció és pH
Egyensúlyi „állandó”
A víz disszociációja,a pH fogalma
Tömeghatás törvénye
Teljes disszociáció
Gyenge savak pH-ja
Titrációs görbe: Erős savat erős bázissal
Titrációs görbe: Erős savat erős bázissal
Többértékű gyenge sav titrálása
Pufferek:
Gyenge sav + erős bázissal képzett sója, vagy
Gyenge bázis + erős savval képzett sója