• Nem Talált Eredményt

A PRINS nem-kódoló RNS kifejeződésének és együttható partnerének tanulmányozása

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2022

Ossza meg "A PRINS nem-kódoló RNS kifejeződésének és együttható partnerének tanulmányozása"

Copied!
13
0
0

Teljes szövegt

(1)

Göblös Anikó1, Szegedi Krisztina1, Bacsa Sarolta1, Bata-Csörgő Zsuzsanna1,2, Kemény Lajos1,2, Széll Márta2,3

1. SZTE-ÁOK, Bőrgyógyászati és Állergológiai Klinika, Szeged 2. MTA-SZTE Dermatológiai Kutatócsopor, Szeged

3. SZTE-ÁOK Orvosi Genetikai Intézet, Szeged

MDT, Budapest 2012. december 7.

A PRINS nem-kódoló RNS kifejeződésének

és együttható partnerének tanulmányozása

(2)

Pikkelysömör

Hiperproliferatív, gyulladásos bőrbetegség

• Heterogén genetikai faktorok Betegség

• Környezeti tényezők kialakulása

Kaukázusi populáció 2-3%-át érinti

(OMIM 177900, www.ncbi.nlm.nih.gov)

T-sejt limfokinek szerepe (Bata et al., 1995)

(3)

PRINS gén azonosítása

Alu elements RNA pol. III prom.

elements

heat shock element

 Differential Display Analyzis

 Psoriasis Susceptibility-related RNA Gene Induced by Stress

 Funkcionális, hosszú, nem-kódoló RNS

In silico transzláció: nem eredményezett fehérjeterméket

Sonkoly et al. 2005

 Szerepet játszik a pikkelysömörre való hajlam kialakításában

 Szerepet játszik a sejtek stressz-regulációjában

(4)

PRINS ncRNS interakciós partner vizsgálata

In vitro binding assay

Speciális ribonukleoprotein (RNP) tisztító KIT SDS-PAGE MALDI-TOF

?

?

PRINS

http://www.pdb.org/pdb/images/2p1b_bio_r_500.jpg?bioNum=2

Nucleophosmin (NPM, B23)

(Szegedi et al., 2009)

(5)

Nucleophosmin (NPM, B23, numartin)

A nucleophosmin egy multifunkcionális foszfoprotein

A nucleophosmin számos sejtműködési folyamatban részt vesz:

• Riboszóma biogenezis

• Sejt proliferáció

• Stresszreguláció

• Genom stabilitás

• Tumor szupresszor gének szabályozása

• Transzkripció szabályozás

Expressziója számos daganatban upregulált

(6)

Célkitűzés

 A PRINS ncRNS szöveti- és sejtbeni eloszlásának vizsgálata In Situ Hibridizációs technikával

 A PRINS ncRNS és NPM interakció funkcionális vizsgálata

• NPM transzlokáció nyomonkövetése UV-B sugárzás hatására humán keratinocitákban

• PRINS ncRNS hatása a NPM transzlokációjára UV-B kezelt keratinocitákban

(7)

PRINS RNS szöveti és sejtszintű eloszlása

A. Tüdő

B. Vékonybél C. Vastagbél D. Nyirokcsomó E. Méhlepény F. Here

G. Bőr H. Bőr

I. Keratinocita

100 µm 100 µm

100 µm

A

B

C

100 µm 100 µm

100 µm

D

E

F

100 µm

50 µm

50 µm

H G

I

(8)

DAPI NPM DAPI NPM Kezeletlen kontroll UV-B kezelt

0 h

3 h

6 h

12 h

24 h

48 h

NPM lokalizáció

A nucleophosmin főként a magvacskában található

(Cordell et al, 1999)

UV-B sugárzást követően a NPM a magplazmába transzlokálódik fibroblaszt, tumor sejtvonal

(Yogev et al, 2008)

A fehérje elhelyezkedésének vizsgálata natív és UV-kezelt humán keratinocitákban (NHEK, HPV- Ker immortalizált sejtvonal)

(9)

PRINS-NPM interakció funkcionális vizsgálata

Gén-specifikus csendesítés:

• PRINS csendesítő konstrukció: AK696

• Scrambled kontroll konstrukció: SC1313

(10)

SC1313 AK696

Kezeletlen kontroll UV-B kezelés SC1313 AK696

3 h

6 h

12 h

24 h

48 h

NPM lokalizáció Immuncitokémia

PRINS gén-specifikus csendesítés (HPV-Ker immortalizált sejtvonal)

Kontroll körülmény UV-B besugárzás

A fehérje sejten belüli elhelyezkedésének vizsgálata

(11)

NPM lokalizáció

Szemikvantitatív analízis

25 látótér/csoport megszámlálása;

NPM elhelyezkedés alapján

(12)

Összefoglalás

• A PRINS ncRNS szerepet játszik a pikkelysömörre való hajlam

kialakulásában, valamint a sejtek stressz regulációjában, csakúgy, mint általunk azonosított interakciós partnere, a NPM fehérje

• Eredményeink arra utalnak, hogy a PRINS ncRNS számos szövetben kifejeződik; kifejeződésének mértéke nagy eltéréseket mutat

• UV-B besugárzott keratinocita sejtekben az intracelluláris NPM lokalizációs mintázat jól korrelál az irodalomban fellelhető adatokkal

• PRINS génspecifikus csendesítés UV-B besugárzott sejtekben hatással van a NPM sejtmagon belüli elhelyezkedésére, tehát mind fizikai, mind

funkcionális kapcsolat fennáll PRINS és NPM között

• Elképzelhető, hogy a PRINS szerepet játszik a sejtek NPM-mediált stressz válaszban

(13)

Prof. Dr. Kemény Lajos Dr. Széll Márta

Dr. Szabó Kornélia Dr. Bebes Attila Dr. Vas Krisztina Tax Gábor

KÖSZÖNÖM A FIGYELMET!

TÁMOP-4.2.2/B-10/1-2010-0012 project

Hivatkozások

KAPCSOLÓDÓ DOKUMENTUMOK

To further validate the functionality of the in  silico predicted and in  vitro determined IL-6 mRNA interacting region in the PRINS sequence, we performed the

UCP2 indukciót követően emelkedett a “szétkapcsolt” proton visszaáramlás (“proton leak”) hyperglycemiás sejtekben, míg a UCP2 csendesítés csökkentette a

Ez a metodika alkalmas mind frissen fagyasztott, mind a degradált RNS-t tartalmazó formalinnal fixált, paraffinba ágyazott mintákban az összes lehetséges

A NOX4 enzim érendotél (EA.hy926) sejtekben való kifejeződésének vizsgálatát követően a molekulák specifitásának ellenőrzésére egy sejtfrakció alapú

In order to evaluate the efficiency of the intra-firm technology transfer system of machine-building enterprises on the basis of the entrepreneurship on the basis of

A KPI-tree-ből származó információk, mind időbeli mind a különböző funkcionális szintekről való felhalmozását követően egy olyan adattárházba

A KPI-tree-ből származó információk, mind időbeli mind a különböző funkcionális szintekről való felhalmozását követően egy olyan adattárházba kerülnek

E kérdés valamennyi magyar népszámlálás kérdőivén szerepelt, indo—- koltsága ma is fennáll, és csupán az merülhet fel, hogy szükséges—e mind ezt, mind pedig az