Biotechnológia
Irányítás, szabályzás
Bioszenzorok
Fermentor típusok
• Batch
• Fed batch
• Folyamatos
Biomassza növekedése
• Számlálás
– Mikroszkóp
– Lemezelés (CFU) – Coulter számláló
Biomassza növekedése
• Számlálás
– Flow citometria
– FACS (fluorescence activated cell sorting)
Biomassza növekedése
• Sejttömeg
– Száraz súly
• szárítószekrényben
– Nedves súly
• centrifuga
– Turbiditás
• spektrofotométerben
– Image analízis
• CCD kamera (félvezető chip, digitális fotoelektromos jelet regisztrál)
• Software illeszti a képeket
Biomassza növekedése
• Metabolikus aktivitás
– Fermentációs hő (pl.
hűtővíz)
– Elektromos paraméterek
• Elektromos vezetőképesség
– Fluoreszcencia
Szaporodást befolyásoló paraméterek
• Hőmérséklet
– mérése:
• hőmérő
• termisztor
• pH
– mérése:
• pH elektród - galvánelem
Szaporodást befolyásoló paraméterek
• Szabad víz
• Mechanikai hatások
– Keverő nyíró hatás – Biofilm
Szaporodást befolyásoló paraméterek
• Szabad víz
• Mechanikai hatások
– Keverő nyíró hatás – Biofilm
Szubsztrát, termék mérése:
oldatban
• HPLC (high performance liquid chromatography)
– gradiens
• pumpák
– oszlop
• méret, ioncsere, fordított fázis
– detektor
• UV-VIS, törésmutató,
vezetőképesség, fluoreszcencia
Szubsztrát, termék mérése: gáz fázisban
• GC (gas chromatograph)
– GC: vivőgáz – oszlop
– detektor
• TCD (thermal
conductivity detector)
• FID (flame ionization detector)
Szubsztrát, termék mérése: gáz fázisban
• GC-MS (gas
chromatograph – mass spectrometry)
– GC: vivőgáz – oszlop
– detektor : MS
• Ionizáló forrás
• elektromos tér gyorsít
• mágneses tér eltérít
• ion tömeg szerint frakciók
Szubsztrát, termék mérése: gázok
• On line gáz áramlási sebesség
– Rotaméter
• áramlási sebesség
hőmérséklet és nyomás függő
– TMFM (thermal mass flow monitor)
• Tömegáram mérés nem függ hőmérséklettől és nyomástól
Szubsztrát, termék mérése: gázok
• Gázösszetétel
– Kimutatás
• O2, CO2: égés, légzés
– Mérés
• GC, GC-MS
• Infravörös abszorpció
– Monoatomosra nem jó
• Mágneses szuszceptibilitás
– O2 : 80°C alatt paramágneses felette diamágneses
Bioszenzorok
• Felépítés:
– Biológiai érzékelő – Jelátalakító
– Mérőműszer
• Előnye:
– Specifikus – Érzékeny
• Hátránya:
– Biol. komponens
• érzékeny
• Instabil
• mérőműszer érzéketlen
Bioszenzorok
• Kanári madár
– Gyors anyagcsere – Érzékeny a
környezetre
– CH4, CO kimutatás
Bioszenzorok - BOI
• Biológiai oxigén igény (BOI, BOD) – Gáznyomást mér
• Corg + O2 = CO2
• NaOH + CO2 = NaCO3 + H2O – Mikróbák fogyasztják az O2-t
– Hőmérséklet – Kevertetés
– Nitrifikáció, toxikus anyagok gátolnak
• Kémiai oxigén igény (KOI, COD)
– KMnO4
Bioszenzorok - elektrokémia
• Glükóz kimutatás
• Gyógyászatban
• Iparban
• Glükóz oxidáz
• FAD fluoreszcencia
• Redox – elektród
• H2O2 - oxidálószer
Bioszenzorok - Immunológia
• Human chorion
gonadotropin (hCG)
– Terhességi teszt
• polipeptid hormon
• petesejt beágyazódást indít
– Ellenanyagok
• hCG ellen: immobilizált,
szabadon mozgó + rögzített pozitív jel
• anti-hCG ellen: negatív kontroll
Bioszenzorok - Immunológia
• Human chorion
gonadotropin (hCG)
– Terhességi teszt
• polipeptid hormon
• petesejt beágyazódást indít
– Ellenanyagok
• immobilizált, másodlagos enzim jelölt
• hCG ellen: szabadon mozgó + rögzített pozitív jel
• anti-hCG ellen: negatív kontroll
Bioszenzorok - ELISA
• Enzyme linked immunosorbent assay (ELISA)
– Általános ellenanyag kikötve – Antigén kötődik
– Specifikus, antigén elleni ellenanyag kötődik
– Anti-antigén másodlagos
ellenanyag marker enzimmel
(HRPO, Biotin-avidin, fluoreszcens festék jelölt) kötődik
– Színreakció
Bioszenzorok - PSR
• Plazmon felületi rezonancia (PSR)
– Fémréteg két oldaláról visszavert fehér fény – Erősítő és gyengítő
rezonanciák
– Hullámhossz és görbe eltolódásából mérjük a makromolekulák közötti kölcsönhatást
Bioszenzorok - QCM
• Kvarc kristály
mikromérleg (QCM)
– Piezoelektromos kvarc kristály
– Mechanikai vibrációra áramot termel
– Nagyon érzékeny a felületi lerakódásokra – Biológiai minta kis
változását méri
Bioszenzorok – QCM
• Monoklonális
ellenanyag QCM
– Antigén-antitest versengés elvén alapul
– Kis molekulákra is jó – IgG tömege egyforma
= változás kvantitatív – Kimutatási idő: 1 perc
Bioszenzorok – DNS chip
– Teljes genom expressziót vizsgál
– Hordozóra a “próba” ezzel hibridizál a “target”
– Egy dimenzió: a target egyszer jelölt pl. radioaktívan
– Két dimenzió: eltérő színű jelölések
• Expressziós mintázat
• Diagnosztikai értékű
Proteomikai munkafázisok
A vad és az fnrT mutáns (FNRTM) törzsek fehérjéinek analízise 2D-gélelektroforézissel
BBS FNRTM
Bioszenzor - fluoreszcencia
• Glükóz
– Glükóz a cukorkötő
concanavalin A fehérjéhez kötődik
– Fluoreszcencia kioltás, ha nincs kötődés
– Tehát ha van fluoreszcencia az arányos a glükóz
koncentrációval
Bioszenzor - fluoreszcencia
• Rekombináns élesztő
– Trinitrotoluol (TNT) bontó enzim – Zöld fluoreszkáló fehérje (GFP) – Érzékeny antiterrorista szenzor
Bioszenzorok - jövő
• Biológia
– Immunológia (10-12 M) vs. Enzim (10-6 M) – Stabilitás
– Szerves oldószerben
• Detektorok
– Kevésbé érzékeny, mint a biológia – On line
– Méretcsökkentés