Közeli infravörös
spektroszkópia és mikroszkópia
Gergely Szilveszter
Budapesti Műszaki és Gazdaságtudományi Egyetem Alkalmazott Biotechnológia és Élelmiszertudományi Tanszék
Optikai spektroszkópia 2014. október 29.
black box
▼ grey box
(N)IR elfogad-
tatása
Rezgések és hullámok (USA vs. Magyarország)
(Tacoma Narrows Bridge, “Gallopin’ Gertie”, 1940. november 7.)
BME:
Schönherz Qpa vs. 4-6
3
Newton kísérletei – a fehéren túl I.
(1704)
Már korábban más is meg-
csinálta, de ő le is írta...
Newton kísérletei – a fehéren túl II.
5
Herschel kísérletei – a vörös alatt
1800. február 11.
Uránusz felfedezése:
1781. márc.
13-án háza udvaráról.
Coblentz kísérletei – az IR ujjlenyomat
etanol CH3–CH2–OH
dimetil-éter H3C–O–CH3
C2H6O, de IR sp. ≠!
7
IR – hő – energia
(egy régi trükk mai kivitelben)
An AC-130U gunship fires flares to emit masses of infrared and confuse heat seeking missiles.
http://www.wired.com/dangerroom/2012/10/infrared-obscurant/
IR sugárzással
a hőkövető rakéták ellen…
A kis
„csillagok”
melegebbek a hajtóműnél.
A molekulák rezgései
Deformációs rezgés
változás a kötésszögben
Szimm. vegyértékrezgés
változás a kötéshosszban
Aszimm. vegyértékrezgés
változás a kötéshosszban
fény-anyag kölcsön-
hatás (csúzlival
verébre)
NIR:
molekula / rezgési spektrosz-
kópia
9
Egy gyors példa a (M)IR-re
NIR : IR___1 : 100De ATR előtt gond a vizes (pl. biológiai) rendszerek-
kel...
1 2 3
O D
0 1 2 3
1100 1300 1500 1700 1900 2100 2300 2500
Wavelength (nm)
O D
víz (H 2 O)
0 1 2 3
1100 1300 1500 1700 1900 2100 2300 2500
Wavelength (nm)
O D
bor
10 mm 4 mm 1 mm 10 mm
4 mm 1 mm
10 mm 4 mm 1 mm
etanol (CH 3 –CH 2 –OH)
És egy másik gyors példa NIR-re
OBI hatóság, Villány, Mór,
Pannon- halma...
termelők sok változó,
kicsi különbségek
▼ kemometria
Murray I.: Scattered information: philosophy and practice of near infrared spectroscopy. 11 In Near Infrared Spectroscopy: Proceedings of the 11th International Conference, Ed by Davies A.M.C., Garrido-Varo A., NIR Publications, Chichester, pp. 1–12 (2004).
Jellemző NIR elnyelési sávok
Minden, ami nekünk kell:
víz, fehérjék, lipidek, szén-
hidrátok.
Foss
Infratec 1241 NIRSystems
Perten DA 7250
Perkin-Elmer Spectrum 400
infravörös berendezés
optikai konfiguráció
interferencia szűrő (ék, diszkrét)
mozgó diffrakciós rács
(holografikus) diódasor
(DA) interferométer (pl. Michelson)
(FT)
fényforrás
izzó (pl. W-halogén, Globar, Nernst)
fénykibocsájtó dióda (LED) hangolható
lézer
detektor
infravörös termikus (termoelem) infravörös foton
(félvezetők, pl.
PbS, InGaAs)
mérési elrendezés
reflexiós (R)
transzmissziós (T)
transzflexiós (TR)
1970-es évek
1980-as évek
1990-es évek
2000-es évek
2010-es évek
szűrők
mozgó diffrakciós rácsok
1970-es évek
1980-as évek
1990-es évek
2000-es évek
2010-es évek
szűrők
mozgó diffrakciós rácsok
Az eszközök csoportosítása,
fejlődése
reflexiós
mérési elrendezés (VIS-NIR / FT-NIR) transzmissziós
mérési elrendezés (NIT)
Foss NIRSystems 6500 + RCA
Foss Infratec 1241 GA
Mérési elrendezések – NIT és NIR
PE Spectrum 400 + NIRA
13 kisebb
hullámhossz nagyobb
energia
λ < λ
E > E
E < E
nagyobb hullámhossz
kisebb energia Ha
NIT & NIR, akkor NIR ≠ ... UV, VIS, NIR, (M)IR,
FIR, ...
Mérési elrendezések – NIT és NIR
E >>
λ <<
>> E
<< λ
(kvázi) inhomogén
magok
(kvázi) homogén
pelletek
15
Közeli infravörös spektrumok
NIT (ave) NIT (×10)
VIS-NIR (×3) FT-NIR (×3)
diszp. × 4 = FT
T
R
Hogyan mérjük? – 3-in-1
diszperziós (DS)
diódasoros (DA)
Fourier-transz- formációs (FT)
„bench-top”:
pre-
„process”:
poszt- diszperzív
Ez most egy pre- diszperzív elrendezés...
Hogyan mérjük? – diszperzió (DS)
.... ez pedig egy poszt- diszperzív elrendezés.
17
Hogyan mérjük? – FT
belső,
„referencia”
lézer
19 Mi mozog?
Semmi:
fix optikai rács.
Automata fényforrás- váltás = folyamatos (24/24) üzem.
Digitális VIS kamera élő képpel. (Pl.
liszt: szita kiszakadt.)
OPC, modbus ASCII, stb.
Hogyan mérjük? – diódasor (DA)
Precíziós mezőgazdaság:
„on-combine” technikák
Long D.:
On-Combine Sensing of grain protein with application to precision agriculture.
Oral presentation. 8thAnnual Precision Agriculture Conference, Hays, KS, USA, January 19-20, 2005
talaj nitrogén profilja (felső ábra)
betakarított gabona „on-combine” NIR technikával mért fehérjetartalma (alsó ábra)
Precíziós mezőgazdaság:
„on-combine” technikák
21
„[...] These measurements can be:
at-line:
Measurement where the sample is removed, isolated from, and analyzed in close proximity to the process stream.
...-line, ...-line, de melyik? I.
Hatalmas potenciál:
sikerül a falat áttörnünk?
23
...-line, ...-line, de melyik? II.
William Whitford W., Julien C.:
Analytical Technology and PAT.
BioProcess InternationalJanuary 2007, 32–41
Az in-/on-line eszköze – a száloptika I.
Igen, törhetnek,
drágák...
:(
25
Az in-/on-line eszköze – a száloptika II.
Az in-/on-line eszköze – a száloptika III.
27
Technológiába illeszthető (egyéb) eszközök I.
Valósidejű:
keverő dobon (fix t helyett adott
minőség).
Több- csatornás elrendezés.
Technológiába illeszthető (egyéb)
eszközök II.
29
In-line rendszerek – pl. őrlemények
Biztos, hogy mindig kell száloptika?
Nem...
In-line rendszerek – pl. folyadékok
31
Mobil, hordozható (handheld) eszközök
Pl. Los Angeles-i rendörség, futószőnyeg szeméttelep.
NIR FT-IR Raman
Ha egyedül nem megy
Áram drót nélkül...33
A feltárás lépései – (IQ)Q = IQ 2
Identification – azonosítás
Ki vagy te?
éles spektrális különbségek keresése
korreláció, euklédeszi távolság stb.
Qualification – minősítés
Hová tartozol?
szubpopulációk definiálása finomabb eltérések alapján
főkomponens analízis (PCA), Mahalanobis-távolság stb.
Quantification – mennyiségi meghatározás
Mennyi az annyi?
referencia paraméterekkel kalibrációk
részleges legkisebb négyzetek (PLS) módszere stb.
A test („vas”) rendben, de
mi van a lélekkel?
Klasszikus API vs. biomolekulák
35
E. coli emlőssejtek
Kikkel termeltetünk?
Tabletta 1-2 paraméter,
de E. coli, CHO ?
Na akkor, modellezzünk...
37
A végső cél
Off-line-tól a real-time-ig
39
Fermentáció ( E. coli ) off-line nyomon követése: PQS módszer
Ha megvanmég a puttonyszám
...
Fermentáció ( E. coli ) off-line nyomon
követése: PQS módszer
41
Fermentáció ( E. coli ) off-line nyomon
követése: PQS módszer
Fermentáció ( E. coli ) off-line nyomon
követése: PQS módszer
43
Fermentáció ( E. coli ) off-line nyomon
követése: PQS módszer
►
►
►
►
Fermentáció ( E. coli ) off-line nyomon
követése: PQS módszer
45
►
►
►
►
Fermentáció ( E. coli ) off-line nyomon
követése: PQS módszer
Fermentáció ( E. coli ) off-line nyomon
követése: PQS módszer
47
Fermentáció ( E. coli ) off-line nyomon
követése: PQS módszer
Fermentáció ( E. coli ) off-line nyomon
követése: PQS módszer
49
A változékonyság leírása: PCA
Méret (PC1)
Kulcs feje (PC2)
Szín
(PC3)
nagy (kapu) átlagos (ajtó) kicsi (asztal)
kerek ovális téglalap sokszögű
oxidált fém kék ciklámen sárga
PC2 vs. PC1
Méret (PC1) Kulcs feje
(PC2)
nagy (kapu) átlagos
(ajtó) kicsi
(asztal) ovális ►
sokszögű ►
téglalap ►
51
PC2 vs. PC3
Szín (PC3) Kulcs feje
(PC2)
kerek ► ovális ► sokszögű ►
oxidált fém kék ciklámen sárga
téglalap ►
Gabona minták termesztési helyei
Franciaország (Clermont-Ferrand) betakarítás éve: 2007
Magyarország (Martonvásár)
betakarítás éve: 2005, 2006, 2007
Lengyelország (Dankow/Choryn) betakarítás éve: 2007
G×E hatás vs. PCA I.
Mert:bio.53
fa jt a G × E k é s z ü lé k
é v já ra t
G×E hatás vs. PCA II.
Forma 1 Forma 2 Forma 3
Forma 4 Forma 5
Polimorf transzformációs vizsgálat:
fénymikroszkópos felvételek
Forma 2
55
Polimorf transzformációs vizsgálat:
in-line Raman-száloptika (PCA)
Fő(bb) kellékei
jól definiált mintasereg
pontos referencia módszerek
megbízható spektroszkópiai eszközök
egzakt matematikai, statisztikai, kemometriai eljárások
A kalibrálás és validálás elemei
Kalibrálás
többváltozós összefüggések, korrelációk keresése
a spektroszkópiai és a referencia adatsorok között
Validálás
a kalibrációs modell
teljesítményének értékelése független mintasorozattal vagy kereszt validálással
A kalibrálás és validálás áttekintése
57
X
kaly
kalreferencia adatok a kalibrációhoz spektroszkópiai
mátrix a kalibrációhoz spektrum-
szelektálás spektrum- transzformáció
reprezentatív mintasereg
spektrum- felvétel
statisztikai adatfeldolgozás
Kalibrálás
referencia-
mérések
független mintasereg, kereszt validálás
spektroszkópiai mátrix a validáláshoz spektrum-
felvétel
referencia- mérések
referencia adatok
(mért) referencia
adatok (becsült)
y’
valy’
valy
valy
val+ ++++
++ ++ ++
+ +++++++
++++ + +
+ + +
+
X
valösszehasonlítás („scatter plot”)
Validálás
59
0 2 4 6 8 10
0 3 6 9 12 15 18 21
Time (hour) Gly (g L-1 )
6 8 10 12
l L-1 )
Fermentáció ( E. coli ) in-line nyomon követése: diszp. NIR-rel PCA, PLS
Habzás- gátló, glükóz adagolása...
Léptéknövelés: 1 litertől 5000 literig
Greiner István: Biotechnológiai gyógyszergyártás.
A Magyar Tudomány Ünnepe – 2013. Az MTA Kémia Tudományok Osztályának előadói ülése. „Kémia a jobb életminőségért” (2013. november 6.) http://www.chemonet.hu/osztaly/kemia/tudnap13/greiner.pdf
API meghatározása – simítás hatása a derivált képzésére
Az első és második deriváltak képzése a
kezeletlen spektrumokból más-más beállításokkal történik:
Diszperziós NIR esetén:
2, 4, 8, 12, 16, 20 nm-es (1, 3, 5, 7, 9, 11 pontos) kapu
[„gap-segment” derivált]
-0,0075 -0,0025 0,0025 0,0075 0,0125 0,0175 0,0225
1100 1300 1500 1700 1900 2100 2300 2500
hullám hossz (nm )
1. derivált log (1/R) [2|0 nm]
0,0400 0,0600 0,0800 0,1000 0,1200
(1/R) [20|0 nm]
NIR
2 nm
1. derivált
1. derivált
63
-0,0045 -0,0035 -0,0025 -0,0015 -0,0005 0,0005 0,0015 0,0025 0,0035 0,0045
1100 1300 1500 1700 1900 2100 2300 2500
hullám hossz (nm)
2. derivált log (1/R) [2|0 nm]
-1,20E-04 -1,00E-04 -8,00E-05 -6,00E-05 -4,00E-05 -2,00E-05 0,00E+00 2,00E-05 4,00E-05 6,00E-05
1100 1300 1500 1700 1900 2100 2300 2500
hullámhossz (nm )
2. derivált log (1/R) [5 pont]
-0,0900 -0,0700 -0,0500 -0,0300 -0,0100 0,0100 0,0300 0,0500 0,0700 0,0900
1100 1300 1500 1700 1900 2100 2300 2500
hullám hossz (nm )
2. derivált log (1/R) [20|0 nm]
-3,00E-05 -2,00E-05 -1,00E-05 0,00E+00 1,00E-05 2,00E-05 3,00E-05
1100 1300 1500 1700 1900 2100 2300 2500
hullámhossz (nm )
2. derivált log (1/R) [49 pont]
NIR FT-NIR
63
2 nm
20 nm
5 pont
49 pont 2. derivált
2. derivált
2. derivált
2. derivált
API meghatározása – diszperziós vs.
FT (pl. detektorok)
0,96 0,96 0,96 0,96 0,96 0,97
0,98 0,98 0,98 0,97 0,97 0,97 0,98 0,99 0,98 0,98 0,98 0,97 0,97 0,95
0,96
0,96
0,96
0,97
0,95
0,96
11
8 8 8 8 8 9
7 7 7 7 7 7
0,5 0,6 0,7 0,8 0,9 1
S D1_2nm D1_4nm D1_8nm D1_12nm D1_16nm D1_20nm D2_2nm D2_4nm D2_8nm D2_12nm D2_16nm D2_20nm 0,88 0,89 0,90 0,91 0,93 0,95 0,96
0,97
0,97
0,98
1,00
1,00
0,89
0,90
0,97
0,97
0,98
0,98
0,97
0,98
0,98
0,98
0,97 0,94
0,91
0,89
0,87
0,95 0,95 0,95 0,65 0,68 0,77 0,85
11
7 7 7 7 8
9 9
11
3
7 8
7 7 7 8
3 0
5 10 15 20 25
Faktor
0,75 0,78 0,79 0,81 0,82 ,72
1 6 0 2 3 4 8 8 0 2 4 0,84
0,80
0,78
0,75
,71
0,84
0,76
1 11 1,5
2 2,5
NIR FT-NIR
1,37 1,31 1,24 1,15 1,01 0,87
3 9 5 1 7 2 5 1,21 1,27 6 ,69 ,73
1,48
1,88
2,21
2,30
0,87
0,87
0,89 1,42 1,28 1,13 0,94
11 11
10 15 20 25
Faktor
alap spektrum
első derivált spektrum második derivált spektrum R
2M S E ( ‰ )
API meghatározása –
teljesítménymutatók (figure of merit)
Kritikus - kontrollált Élelmiszer botrányok:
mert jobb az analitika + a híráramlás.
1 3
7 4 6 7 5
11 14 18 31 30
49
58 57 58 48
52
1 2 2 1 4 6 4
10 9 5
16 17 15 13 22
0 10 20 30 40 50 60 70
1994 1996 1997 1998 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015
közlemény (db)
év Web of Science
ScienceDirect
65
„near-infrared AND imaging AND pharma” kulcsszóra történő keresés
Web of Science
ScienceDirect
Progresszív fejlődés
Spektrális hiperkocka
Spektrális hiperkocka vs. tudomány
De mi volt 1994 előtt?
Gyilok.
Lewis E.N., Carroll J.E., Clarke F.:
A near infrared view of pharmaceutical formulation analysis.
NIR news 12(3), 16–18 (2001)
Az eszközök fejlődése – (hideg)
háborúkon keresztül (II. világháború)
Éjjellátók kezdete:
„vámpír egység”
(németek).
67
Az eszközök fejlődése – (hideg)
háborúkon keresztül (hideg háború)
http://www.togtech.com/huge-cold-war-camera-with-100-inch-infrared-lens-takes-two-to-operate/
Harc a hadizsák- mányért…
(USA vs.
Szu.).
Sok új USA / Szu. fegyver
német alapokon…
Az eszközök fejlődése – (hideg)
háborúkon keresztül (Korea, Vietnam)
Még ma is megvásárol- ható az interneten.
69
Az eszközök fejlődése – (hideg) háborúkon keresztül (pl. Irak)
http://www.wired.com/dangerroom/2013/04/darpa-infrared-cameras/
DARPA:
lásd még a robotkutyát
is…
Mai cél:
kisebb berendezés,
jobb felbontás.
Civil alkalmazások – hideg/meleg I.
Energia- osztályba
sorolás:
hol szökik a hő…
71
Civil alkalmazások – hideg/meleg II.
http://coolcosmos.ipac.caltech.edu/image_galleries/ir_zoo/coldwarm.html
A fej leghidegebb
pontja:
fülünk.
(Égett ujj…)
Melegvérű ember
vs.
hidegvérű gekkó …
... vagy skorpió.
Kutyalihegés
= hőleadás.
(Bőrén nincsenek
pórusok.)
Civil alkalmazások – hideg/meleg III.
Törött középső ujj gyógyulása
Szomato infra:
73
Egér a Marsról I.
Golde T.E., Bacskai B.J.:
Amyloid deposits can be rapidly detected in the brains of living mice using a novel ligand and near-infrared fluorescence imaging.
Nat. Biotechnol.23(5), 552–554 (2005)
Sokszor csak a bonc- asztalon látjuk az Alzheimer-
kór állapotát.
Korai észlelés és terápia:
jobb esélyek.
NIR kamera segít.
Itt már aktív:
IR besu- gárzás, DE
roncsolás- mentes
Egér a Marsról II.
75
Szexálás I.
Sumriddetchkajorn S., Chakkrit Kamtongdee C.:
Optical penetration-based silkworm pupa gender sensor structure.
Appl. Optics51(4), 408–412 (2012)
Tenyésztés szempontjából
fontos, hogy mi van a bábban.
Bábot megbontani
nem lehet, mert akkor elpusztul…
Szexálás II.
Nézzünk bele a NIR segítségével aselyemhernyó bábjába!
77
Szexálás III.
Sumriddetchkajorn S., Chakkrit Kamtongdee C.:
Optical penetration-based silkworm pupa gender sensor structure.
Appl. Optics51(4), 408–412 (2012)
Lányoknál semmi extra …
… de a fiúknak világít a „farkuk”.
Pár/tíz mikrométeres nagyságrendek(től)
Látható kép: vizsgálandó terület megkeresése, majd (N)IR mérés
Nem, vagy csak kis mintaelőkészítést igényel: kevesebb hiba
Különböző mérési módok: heterogén minták könnyebb vizsgálata
Mikro/makroszkópos képalkotás I.
Meddig tart?
Más megoldás lehet jó…
(bemozdult fénykép)
79
Mikro/makroszkópos képalkotás II.
pont kép
Mikro/makroszkópos képalkotás III.
A 16 elemből álló detektorsor a mintát 100 µm × 6,25 µm vagy
81
FPA (Focal Plane Array)
Mikro/makroszkópos képalkotás IV.
videotelefon fejlesztése (AT&T): 1969!
Mikro/makroszkópos képalkotás V.
T (transz- misszió)
83
Mikro/makroszkópos képalkotás VI.
E
R
mintafelszín
E R
spekuláris reflexió
diffúz reflexió
gyengített teljes reflexió
(ATR)
R (reflexió)
mintafelszín mintafelszín
Mikro/makroszkópos képalkotás VII.
Cassegrain objektív
ATR kristály ÉS minta
elmozdulás (x,y)
31
Mikro/makroszkópos képalkotás VIII.
Technológia nyomon követése I.
bevonás
Képalkotás – tablettavizsgálatok
bevonat (Opadry Pink): idő előrehaladtával erősödő jel 1390 nm-en
korpusz: idő előrehaladtával gyengülő jel 2120 nm-en
87
Technológia nyomon követése II.
keverés
Eredetiségvizsgálat
Gendrin C. et al.:
Content uniformity of pharmaceutical solid dosage forms by near infrared hyperspectral imaging: A feasibility study.
Talanta73(4), 733–741 (2007)
Gendrin C. et al.:
Pharmaceutical applications of vibrational chemical imaging and chemometrics: A review.
Journal of Pharmaceutical and Biomedical Analysis48(3), 533–553 (2008)
Képalkotás – tablettavizsgálatok
NIR VIS Hamis Eredeti
Pl. hamis Viagrában a
kék színt patkányméreg
adta.
Nem kell eltörni, a „NIR”
belelát.
(Megmarad a bizonyíték.)
Eredeti Hamis
Eredetiségvizsgálat vs. imaging:
makro (VIS)
Edzőteremben izomnövelő
helyett
„barkács cucc”.
89
Eredeti Hamis
Eredetiségvizsgálat vs. imaging:
makro (NIR)
PCA Abs.
Mátrixhatás.
• Képalkotás NIR tartományban:
nincs roncsolás
• 400 × 400 μm méretű mérési tartomány, 6,25 × 6,25 μm méretű képpontokkal
• 64 × 64 pont, azaz összesen 4096 pont, pontonként 128 spektrum átlagolásával
• Átlagos abszorbancia értékek alapján színezett ábrák
Technológiai probléma vs. imaging
Probléma a tabletta felületén:
mi az oka?
Spórolás miatt más alapanyag, bevonathiányt
okozott.
91
Hatóanyag R
2=0,88-0,96
Filmbevonat (Opadry®) R
2=0,41-0,54
Technológiai probléma vs. imaging:
korrelációs térképek (2D és 3D)
lószúnyog szárnya: 18,5 mm × 4,5 mm = 132 000 spektrum
Képes képtelenségek
Anyagok azonosítása
(vegyszer, lőpor) az
Szerkezet, összetétel megállapítása
roncsolás nélkül.
93
A (N)IR módszerek, technológiák előnyei
Roncsolásmentes (fermentáció, anyagazonosítás, homogenitás, bevonat, hamisítás, visszáru, csomagolóanyag stb.)
Gyors (jelsorozatok (másod)perces nagyságrendben képezhetők)
Rengeteg rejtett információ megfejthető (adatbányászat, oknyo- mozások)
Gyors visszacsatolás a technológiába, minőségellenőrzésbe, mi- nőségbiztosításba
FDA „alternatív” módszere
Költséghatékony, nagy áteresztőképességű
Tudásintenzív módszerek
A nemtudás tudása a tudás kezdete...Köszönetnyilvánítás
Párta László
1, Ballagi András
1Kiss Violetta
2, Finta Zoltán
2Horgos József
3,4, Zelkó Romána
4Jekő József
5, Csorvássy István
5Lakatos László
6, Axel Rau
7Izsó Eszter
8, Tieger Eszter
8, Lőrincz Áron
8, Kontsek Endre
81