• Nem Talált Eredményt

Indiai szemfertőzésekből származó aspergillus izolátumok fajszintű azonosítása és genetikai variabilitásának vizsgálata

N/A
N/A
Protected

Academic year: 2022

Ossza meg "Indiai szemfertőzésekből származó aspergillus izolátumok fajszintű azonosítása és genetikai variabilitásának vizsgálata"

Copied!
18
0
0

Teljes szövegt

(1)

Indiai szemfertőzésekből származó Aspergillus izolátumok molekuláris

azonosítása és széleskörű jellemzése

BARANYI Nikolett1, SAMU Aliz1, KOCSUBÉ Sándor1, SZEKERES András1, KREDICS László1, Palanisamy MANIKANDAN2, VARGA János1

1 Szegedi Tudományegyetem, Természettudományi és Informatikai Kar, Mikrobiológia Tanszék, 6726 Szeged, Közép fasor 52

2 Aravind Eye Hospital and Postgraduate Institute of Ophthalmology, Coimbatore, Tamilnadu, India

(2)

Aspergillus

Elterjedt nemzetség mintegy 300- 350 fajjal

Fajai jelentősek az élelmiszer- és biotechnológiai iparban, mint

opportunista patogének és mint mikotoxin termelők

Jelentőségét jelzi, hogy eddig több mint 20 faj genomját

szekvenálták meg!

Általában raktári penészként tartják számon (postharvest kontamináció)

2

(3)

Keratitisz

A kornea gyulladásos folyamatai (baktérium, vírus, gomba)

Keratomikózis: Leggyakrabban Candida, Fusarium és Aspergillus fajok az előidézői

Aspergillus keratitisz leggyakoribb kórokozói: A. flavus, A.

fumigatus, A. terreus és A. niger

Ok: Szaruhártya sérülése, többnyire mezőgazdasági munka során

(4)

Célkitűzések

52 indiai szemfertőzésből származó, morfológiai vizsgálatok alapján az Aspergillus nemzetség

Flavi szekciójába sorolt izolátum fajszintű azonosítása

A párosodási típus gének (MAT) eloszlásának vizsgálata az izolátumokban

Aflatoxin termelő képesség vizsgálata

Gombaellenes szerekkel szembeni érzékenység

vizsgálata

(5)

Fajazonosítás

• Az izolátumok fajszintű

azonosítása részleges kalmodulin szekvenciáik alapján történt

•A. flavus (46), A. tamarii (4), A.

terreus (1), A. pseudotamarii (1)

• A törzsfa készítés (493

nukleotidnyi DNS szakaszok, neighbor-joining módszer)

1076/10 670/10 309/10 702/10 839/11 889/10 1060/10 881/10 775/10 816/10 832/10 811/10 243/11 1382/10 1224/10 1303/10 1083/10 1251/10 856/10 457/11 1149/10 1333/10 864/10 1084/10 1022/10 67/11 875/10 929/10 28/11 177/11 1023/10 40/11 656/10 23/11 343/11 883/10 1122/10 34/11 14

A. flavus CBS 100927 792/10

1065/10 711/10 1257/10 802/10 800/10 101/11

A. parasiticus CBS 100926 A. sojae CBS 100928

A. pseudotamarii CBS 766.97 A.pseudotamarii CBS 765.97 763/10

693/10 694/10 653/10 613/10

A. tamarii CBS 484.65 A. tamarii CBS 104.13 A. nomius CBS 260.88

0.005

A. pseudotamarii

A. tamarii A. flavus

(6)

Fajazonosítás eredménye

A. flavus

Változatos elterjedésű

Leggyakoribb aflatoxin termelő faj (B1+B2)

Emberre és állatra egyaránt patogének lehetnek

A. tamarii

Változatos elterjedésű

Nem termel aflatoxinokat

Keleti fermentációkban alkalmazzák (A. terreus)

A. flavustelepmorfológiája CYA táptalajon és egy konídiumtartó mikroszkópos képe

A. tamariitelepmorfológiája CYA és MEA táptalajon

(7)

A. pseudotamarii

Elsőként azonosítottuk, mint opportunista humán patogént

2001-ben írták le, mint aflatoxin termelő fajt (Ito és mtsi)

Aflatoxin B1+B2 termelő

Előfordulás: Japán, Argentína, Brazília, India

Az Aspergillus pseudotamarii telepmorfológiája MEA táptalajon (balra) és CYA

táptalajon (jobbra) A. pseudotamarii konídiumtartó és a konídiumok mikroszkópos képe

(8)

Az izolátumok párosodási típus génjeinek vizsgálata

Specifikus primerpárokkal végzett PCR reakcióval végeztük el

MAT1-1 primerpárral 396 bp méretű fragmentet vártunk, míg MAT1-2 primerpárral 270 bp méretűt

Valamennyi általunk vizsgált izolátum a MAT1-1 idiomorfot hordozta

A párosodási típus gének előfordulása különböző Aspergillus törzsekben

(Ramirez-Prado és mtsi 2008)

(9)

Aflatoxinok

Dekaketid kumarin származékok

Az IARC az aflatoxin B1-et az elsőszámú karcinogének csoportjába sorolta (1982)

Az aflatoxin B1 hepatotoxikus és hepatokarcinogén hatású, akut esetben toxikus hepatitiszt idéz elő

Legfontosabb termelők: A. flavus (B), A. parasiticus (B&G), A. nomius (B&G)

Aflatoxin B1, B2, G1, G2, M1, M2

Előfordulás: földimogyoró, gyapot, kukorica, búza, stb.

(10)

Aflatoxin termelő képesség

Az izolátumok aflatoxin termelő képességét YES tápoldatban vizsgáltuk

A. pseudotamarii (BHI, RPMI 35°C)

Az A. flavus izolátumok 50%-a bizonyult aflatoxin termelőnek TLC analízis alapján

Az A. flavus izolátumok 0.1-150 g/ml közötti

mennyiségben termeltek aflatoxin B1-et, és 0.05-5 g/ml mennyiségben aflatoxin B2-t HPLC analízisük alapján

(11)

Az A. pseudotamarii izolátum által YES tápoldaton termelt aflatoxinok

HPLC kromatogramja

Az izolátum 1 g/ml aflatoxin B1-et, és 0.0026 g/ml aflatoxin B2-t termelt

(12)

Antifungális érzékenység vizsgálata

Korongdiffúziós teszt

6 gombaellenes szer (Mikonazol, Terbinafin,

Voriconazol, Clotrimazol, Econazol, Flucitozin) (BioLab)

Eredmény: Flucitozinnal szemben a vizsgált izolátumok 100%-a érzéketlennek bizonyult

Terbinafinnal szemben a legérzékenyebbek

Az izolátumok 47%-a bizonyult érzékenynek Vorikonazollal szemben

AzAspergillus pseudotamarii gombaellenes szerekkel szembeni érzékenysége 48 órás inkubáció után

A z ábrán szereplő jelölések: MCZ (mikonazol), TRB (terbinafin), VOR (vorikonazol), CLT (klotrimazol), ECO (ekonazol), 5 FC

(flucitozin vagy 5- fluorocitozin

ECO

VOR TRB

MCZ CLT

5FC

(13)

Antifungális érzékenység vizsgálata

E-teszt

8 gombaellenes szer: Anidulafungin, Amphotericin B, Micafungin, Itrakonazol, Flukonazol, Caspofungin,

Posaconazol és Voriconazol (bioMérieux)

Eredmény: Flukonazollal szemben az izolátumok 100%- a érzéketlennek bizonyult

Hatásos: Amphotericin B, Itrakonazol, Posaconazol és Voriconazol

Anidulafungin, Micafungin és Caspofungin esetében a gátlási zónán belül mikrokolóniák jelentek meg

A. flavusizolátum gombaellenes szerekkel szembeni érzékenysége 48 órás inkubáció után

A z ábrán szereplő jelölések: AND (Anidulafungin), VOR (Vorikolnazol)

(14)

További indiai izolátumok

A. fumigatus(9), A. niger(2), A. terreus(3)

A. lentulus(2) (Indiában elsőként mutattuk ki, mint keratitiszt előidéző fajt)

A. eucalypticola(3), A. neoniger(1)

(elsőként azonosítottuk, mint humán

patogén fajt)

(15)

A klímaváltozás következménye

(16)

Összefoglalás

A vizsgált izolátumok közül 46 az A. flavus, 4 az A. tamarii, míg 1-1 izolátum az A. terreus és A. pseudotamarii fajba tartoztak

Az A. pseudotamarii-t elsőként sikerült azonosítanunk, mint humán patogén szervezetet

Valamennyi A. flavus, A. tamarii és az A. pseudotamarii izolátum a MAT1-1 idiomorfot hordozta

Az A. flavus izolátumok egy része és az A. pseudotamarii izolátum termelt mind aflatoxin B1-et, mind B2-t YES

tápoldatban

Antifungális szerekkel szembeni érzékenység vizsgálata során hatásosnak bizonyultak: Itrakonazol, Mikonazol, Voriconazol, Clotrimazol, Econazol, Posaconazol, Terbinafin és

Amphotericin B

(17)

Köszönetnyilvánítás

Prof. Vágvölgyi Csaba

Bencsik Ottó

Szigeti Gyöngyi

Szegedi Tudományegyetem TTIK Mikrobiológia Tanszék

Aravind Eye Hospital and Postgraduate Institute of Ophthalmology

A kutatási munkát „Az SZTE Kutatóegyetemi Kiválósági Központ tudásbázisának kiszélesítése és hosszú távú szakmai fenntarthatóságának megalapozása a kiváló tudományos utánpótlás biztosításával”

című, TÁMOP-4.2.2/B-10/1-2010-0012 azonosítószámú projekt támogatja. A projekt az Európai Unió támogatásával, az Európai Szociális Alap társfinanszírozásával valósul meg.

(18)

Köszönöm a figyelmet!

Hivatkozások

KAPCSOLÓDÓ DOKUMENTUMOK

1) Az integrin-jelátvitel vizsgálata hemopoetikus eredetű sejtekben 2) Jelátviteli folyamatok vizsgálata a neutrofilek sejtvándorlása során 3) Az Fc-receptorok szerepének

 A részletes genetikai vizsgálat eredményeképpen három család esetében az eddig ismert valamennyi hajlamosító tényező vizsgálata negatívnak bizonyult, utalva arra,

Az alternatív promóter használat következtében a fehérjéből például több keletkezik az emlőmirigyekben, mint az idegsejtekben (29).. A többi gén esetén sem

A vörösvértest expressziós mérések során is találtunk olyan önkéntes donorokat, akik alacsonyabb ABCG2 szinttel rendelkeznek, de az exon szekvenálás során nem

A genetikai diagnózis prognosztizálja a várható hosszútávú látási teljesítményt (LCA vagy EORD), megkönnyíti a várható kórlefolyás megítélését és

Korai életkorban kezdődő retina disztrófiás betegeket (LCA-EORD) sem a magyar népességben, sem Közép-Európában modern klinikai és genetikai módszerekkel nem

3.2.6 A SNAP-25 gén 3’ szabályozó régiójában lév ő rs3756544 és rs1051312 poli- morfizmusok genotípusainak és haplotípusok közvetlen, molekuláris elemzése Mivel

Az általunk vizsgált SNAP-25 gén jól példázza azt a nem ritka esetet, hogy egy gén illetve az általa kódolt fehérje variabilitása nem csak az adott